#NEXUS [MacClade 4.08 registered to Biology Department, Duke University] BEGIN DATA; DIMENSIONS NTAX=108 NCHAR=1520[1524]; FORMAT DATATYPE=DNA[SYMBOLS = "ACGT-0123456789BDEFH"] MISSING=? 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[1486] Sinorhizobium_meliloti_1021 ??CAACTTGAG-AGTTTGATCCTGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAGCGC-C--CCGC-AAGG-G-GAG-CGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGG-AATCTACCCTTTTCTACGGAATAACGCAGGGAAACTTGTGCTAATACCGTATGAGCCCTTCG-GGGGAAAGATTTA-TCGGGAAAGGATGAGCCCGCGTTGGATTAGCTAGTTGGTGGGGTAAAGGCCTACCAAGGCGACGATCCATAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTACGGGA-GGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTCACCGGTGAAGATAATGACGGTAACCGGAGAAGAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGGCTAGCGTTGTTCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCACGTAGGCGGATTGTTAAGTGA-GGGGTGAAATCCCAGGGC-TCAACCCTGGAACTGCCTTTCATACTGGCAATCTAGAGTCCAGAAGAGGTGAGTGGAATTCCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGGAGGAACACCAGTGGCG--AAGGCGGCTCACTGGTCTGGAACTGACGCTGAGGTGCGAAA-GCGTGGGGAGCA-AACAGGATTAGA-TACCCTGGTAGT-CCACGCCGTAA-ACGATGAATGTTAGCCGTCGGGCAGTTTACTGTTCGGTGGCGCAGCTAACGCATTAAACATTCCGCCTGGGG-AGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATCCCGATCGC-GGATACGAGAGATCGTATCCTTCAGTTCGGCTGGATCGGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTCGCCCTTAGTTGCCAGCATTCAGTTGGGCACTCTAA-GGGGACTGCCGGTGATAAGCCGAGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGTGGTGACAGTGGGCAGCGAGACCGCGAGGTCGAGCTAATCTCCAAAAGCCATCTCAGTTCGGATTGCACTCTGCAACTCGAGTGCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGCAGATCAGCATGCTGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTCTACCCGAAGGTAGTGCGCTAA--CCGCAA-GG--AGGCAGCTAACCACGGTAGGGT-CAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTT???? [1490] Mesorhizobium_amorphae ??????????G-AGTTTGATCCTGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAGCGC-C--CCGC-AAGG-G-GAG-CGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGG-AATCTACCCATCTCTACGGAACAACTCCGGGAAACTGGAGCTAATACCGTATACGTCCTTCG-GGAGAAAGATTTA-TCGGAGATGGATGAGCCCGCGTTGGATTAGCTAGTTGGTGGGGTAATGGCCTACCAAGGCGACGATCCATAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGA-GGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGAAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTCAACGGTGAAGATAATGACGGTAACCGTAGAAGAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGGCTAGCGTTGTTCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCACGTAGGCGGATACTTAAGTCA-GGGGTGAAATCCCGGGGC-TCAACCCCGGAACTGCCTTTGATACTGGGTATCTCGAGTCCGGAAGAGGTGAGTGGAATTCCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGGAGGAACACCAGTGGCG--AAGGCGGCTCACTGGTCCGGTACTGACGCTGAGGTGCGAAA-GCGTGGGGAGCA-AACAGGATTAGA-TACCCTGGTAGT-CCACGCCGTAA-ACGATGGAAGCTAGCCGTTGGCAAGTTTACTTGTCGGTGGCGCAGCTAACGCATTAAGCTTCCCGCCTGGGG-AGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATCCCGGTCGC-GGTTTCCAGAGATGGATTCCTTCAGTTCGGCTGGACCGGTGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTCGCCCTTAGTTGCCAGCATTAAGTTGGGCACTCTAA-GGGGACTGCCGGTGATAAGCCGAGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGTGGTGACAGTGGGCAGCGAGACCGCGAGGTCGAGCTAATCTCCAAAAGCCATCTCAGTTCGGATTGCACTCTGCAACTCGAGTGCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGCCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTTTACCCGAAGGCGCTGTGCTAA--CCGCAA-GG--AGGCAGGCGACCACGGTAGG-T-CAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCC?????? 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[1493] Methylosinus_trichosporium ??????????????????????????????AACGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAACGGGCG-CAGC-AATGCGTCAG-TGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGG-AACGTGCCCTTCGGTTCGGAATAACTCAGGGAAACTTGAGCTAATACCGGATACGCCCTTTG-GGGGAAAGATTTA-TTGCCGAAGGATCGGCCCGCGTCCGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAAGGCTCACCAAGGCGACGATCGGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGA-GGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTCGCCAGGGACGATAATGACGGTACCTGGATAAGAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGGCTAGCGTTGTTCGGAATCACTGGGCGTAAAGCGCACGTAGGCGGATCTTTAAGTCA-GGGGTGAAATCCCGAGGC-TCAACCTCGGAACTGCCTTTGATACTGGAGGTCTAGAGTCCGGGAGAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCAGTGGCG--AAGGCGGCTCACTGGCCCGGAACTGACGCTGAGGTGCGAAA-GCGTGGGGAGCA-AACAGGATTAGA-TACCCTGGTAGT-CCACGCCGTAA-ACGATGGATGCTAGCCGTTGGGGAGCTTGCTCTTCAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATCCCGCCTGGGG-AGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCTTTTGACATGTCCAGTAT-GGTCGCCAGAGATGGCTTCCTTCCCGCAA-GGGGCTGGAACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTCGCCCTTAGTTGCCATCATTCAGTTGGGCACTCTAG-GGGGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACAGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGAAGCGAAGGGGTGACCCGGAGCAAATCTCCAAAAGCCGTCTCAGTTCGGATTGCACTCTGCAACTCGAGTGCATGAAGGTGGAATCGCTAGTAATCGCAGATCAGCACGCTGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGCTTTACCCGAAGGCGTTTCGCTAA--CCGCAA-GG--AGGCAGACGACCACGGTAGGGT-CAGCGACTGGGGTG?????????????????????????????????????????????????????? [1494] Methylosinus_acidophilus ?????????AGAG-TTTGATTATGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAACGC-TG-TAGC-AATACA-GAG-TGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGG-AACGTGCCTTTCGGTTCGGAATAACTCAGGGAAACTTGAGCTAATACCGGATACGCCCTTCG-GGGGAAAGATTTA-TTGCCGAAAGATCGGCCCGCGTCCGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCCCACCAAGGCGACGATCGGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGA-GGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGATGAGGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTCGCCAGGGACGATAATGACGGTACCTGGATAAGAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGGCTAGCGTTGTTCGGAATCACTGGGCGTAAAGCGCACGTAGGCGGATCTTTAAGTCA-GGGGTGAAATCCCGAGGC-TCAACCTCGGAACTGCCTTTGATACTGGGGGTCTAGAGTCCGGGAGAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCAGTGGCG--AAGGCGGCTCACTGGCCCGGTACTGACGCTGAGGTGCGAAAAGCGTGGGGAGCA-AACAGGATTAGA-TACCCTGGTAGT-GCACGCCGTAA-ACGATGGATGCTAGCCGTTGGGCAGCTTGCTGTTCAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATCCCGCCTGGGG-AGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCTTTTGACATGTCTAGTAT-GGTCGCCAGAGATGGCTTCCTTCCCGCAA-GGGGCTAGAACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTCGCCCTTAGTTGCCATCATTCAGTTGGGCACTCTAG-GGGGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACAGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGACGCGAAGGGGCGACCCTTAGCAAATCTCAAGAAACCGTCTCAGTTCGGATTGCACTCTGCAACTCGAGTGCATGAAGGTGGAATCGCTAGTAATCGCAGATCAGCACGCTGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGCTTTACCCGAAGGCGTTTCGCTAA--CCGCAA-GG--AGGCAGACGACCACGGTAGGGT-CAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTTATG [1492] Methylobacterium_populi_BJ001 ?????????AGGG-TTTGATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAACGGGCT-TCTT-CGGAAGTCAG-TGGCAGACGGGTGAGTAACACGTGGG-AACGTGCCCTTCGGTTCGGAATAACTCAGGGAAACTTGAGCTAATACCGGATACGCCCTTAC-GGGGAAAGGTTTA-CTGCCGAAGGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTTGTTGGTGGGGTAACGGCCTACCAAGGCGACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGA-GGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCTTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTCCGGGACGATAATGACGGTACCGGAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGGCTAGCGTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGCGCGTAGGCGGCCGATTAAGTCG-GGGGTGAAAGCCTGTGGC-TCAACCACAGAATTGCCTTCGATACTGGTTGGCTTGAGACCGGAAGAGGACAGCGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCAGTGGCG--AAGGCGGCTGTCTGGTCCGGTTCTGACGCTGAGGCGCGAAA-GCGTGGGGAGCA-AACAGGATTAGA-TACCCTGGTAGT-CCACGCCGTAA-ACGATGAATGCCAGCCGTTGGCCTGCTTGCAGGTCAGTGGCGCCGCTAACGCATTAAGCATTCCGCCTGGGG-AGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACACGCAGAACCTTACCATCCCTTGACATGGCATG-TT-AC-CTCGAGAGATCGGG-GATCCTCTTCG-GAGGCGTGCACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCACGTCCTTAGTTGCCATCATTCAGTTGGGCACTCTAG-GGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGTGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACGGGATGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAGTGGGACGCGAAACCGCGAGGTTGAGCAAATCCCCAAAAGCCGTCTCAGTTCGGATTGCACTCTGCAACTCGGGTGCATGAAGGCGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCACGCCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTCTTACCCGACGGCGCTGCGCCAA--CCGCAA-GG--GGGCAGGCGACCACGGTAGGGT-CAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCTA [1490] Methylobacterium_thiocyanatum ?????????AGAG-TTTGATCATGGCTCAAAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAATTCGAACGGGCT-TCTT-CGGAAGTCAG-TGGCAGACGGGTGAGTAACACGTGGG-AACGTGCCCTTCGGTTCGGAATAACTCAGGGAAACTTGAGCTAATACCGGATACGCCCTTAT-GGGGAAAGGTTTA-CTGCCGAAGGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTTGTTGGTGGGGTAACGGCCTACCAAGGCGACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCTTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTCCGGGACGATAATGACGGTACCGGAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGGCTAGCGTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGCGCGTAGGCGGCCGATTAAGTCG-GGGGTGAAAGCCTGTGGC-TCAACCACAGAATTGCCTTCGATACTGGTTGGCTTGAGACCGGAAGAGGACAGCGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCAGTGGCG--AAGGCGGCTGTCTGGTCCGGTTCTGACGCTGAGGCGCGAAA-GCGTGGGGAGCA-AACAGGATTAGA-TACCCTGGTAGT-CCACGCCGTAA-ACGATGAATGCCAGCCGTTGGCCTGCCTGCAGGTCAGTGGCGCCGCTAACGCATTAAGCATTCCGCCTGGGG-AGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCATCCCTTGACATGGCATG-TT-AC-CTCGAGAGATCGGG-GATCCTCTTCG-GAGGCGTGCACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCACGTCCTTAGTTGCCATCATTCAGTTGGGCACTCTAG-GGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGTGGATGACGTCAAGTCTTCATGGCCCTTACGGGATGGGCTACACACGTGTCACAATGGCGGTGACAGTGGGACGCGAAACCGCGAGGTTGAGCAAATCCCCAAAAGCCGTCTCAGTTCGGATTGCACTCTGCAACTCGGGTGCATGAAGGCGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCACGCCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTCTTACCCGACGGCGCTGCGCCAA--CCGCAA-GG--GGGCAGGCGGCCACGGTAGGGT-CAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACC??????????????????????????????????? [1491] Methylobacterium_lusitanum ????????????G-TTTGATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAACGGGCT-TCTT-?GGACGTCAG-TGGCAGACGGGTGAGTAACACGTGGGTAACGT?CCCTTCGGTTCGGAATAACTCAGGGAAACTTGAGCTAATACCGGATACGCCCTTTT-GGGGAAAGGGTTGACT-CCGAAGGATCGGCCCGCCTCTGATTAGCTTGTTGGTGGGGTAACGGCCTACCAAGGCGACGATCAGTAGCTAGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGA-GGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCTTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTCCGGGACGATAATGACGGTACCGGAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGGCTAGCGTTGCTCGGGATCAGTGGGCGTAAAGGGCGCGTAGGCGGCCGATAAAGTCG-GGGGTGAAAGCCTGTGGC-TCAACCACAGAATTGCCTTCGCTACTGGTTGGCTTGAGACCGGAAGAGGACAGCGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCGAGAGCACCAGTGGCG--AAGGCGGCTGTCTGGTCCGGTTCTGACGCTGAGGCGCGAAA-GCGTGGGGAGCA-AACAGGATTAGA-TACCCTGGTAGT-CCACGCCGTAA-ACGATGAATGCCAGCCGTT--CCTGCTTGCAGGTCAGT?GCGCCGCTAACGCATTAAGCATTCCGCCTGGGG-AGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGG-CCGCACAAGCGATGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCATCCCTTGA?ATGGCATG-TT-AC-CTGGAGAGATCCAG-GGTCCTCTTCG-GAGGCGTGCACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCACGTCCTTAGTTGCCATCATTCAGTTGGGCACTCTAG-GGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGG?AGGTGTGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACGGG-TGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAGAGGGACGCGAACCTGCGAGGTTGAGCAAATCCC-AAAAGCGCTCTCAGTTCGGATTGCACTCTGCAACTCGGGTGCATGAAGGCGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCACGCCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTCTTACCCGACGGC?CTGCGCCAA--C?GCAA-GG--A?GCA?GCGAC?ACGGTAGGGT????????????????????????????????????????????????????????????????????? [1487] Methylobacterium_zatmanii ??CAACTTGAGAG-TTTGATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAACGGGCA--CTT-CGGGTGTCAG-TGGCAGACGGGTGAGTAACACGTGGG-AACGTGCC-TTCGGTTCGGAATAACTCAGGGAAACTTGAGCTAATACCGGATACGCCCTTC?-GGGGAAAGGTTT?-CT?C-GAAG?ATCGGCCCGCGTCTGATTAGCT?GTTGGTGGGGTAACGGCCTACCAAGGCGACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGA-GGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCTTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTCCGGGACGATAATGACGGTACCGGAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGGCCAGCGTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGCGCGTAGGCGGCCGATTAAGTCG-GGGGTGAAAGCCTGTGGC-TCAACCACAGAATTGCCTTCGATACTGGTTGGCTTGAGACCGGAAGAGGACAGCGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCAGTGGCG--AAGGCGGCTGTCTGGTCCG??TCTGACGCTGAGGCGCGAAA-GCGTGGGGAGCA-AACAGGATTAGA-TACCCTGGTAGT-CCACGCCGTAA-ACGATGAATGCCACGCGTTGGCCTGCTTGCAGGTCAGTGGCGCCG-TAACGCATTAAGCATTCCGCCTGGGG-AGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGA?TTGACGGGGG-CCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGG?TTAATCCGAA??AACGCGCAGAACCTTACCATCCCTTGACATGGCATG-TT-AC-CTCGGGAGACCGGG-??TCCTCTTCG-GAGGCGTGCACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCACGTCCTTAGTTGCCATCATTCAGTTGGGCACTCTAG-GGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGTGGATGACGTCAAGTCCTCATGG?--TTACGGGATGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAGTGGGA-GCGAAACCGCGAGGTCGAGCAAATCCCCAAAAACCGTCTCAGTTCGGATTGCACTCTGCAACTCGGGTGCATGAAGGCGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCACGCCACGGTGAATACGTT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? [1488] Methylobacterium_chloromethanicum_CM4 ?????????AGAG-TTTGATCCTGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAACGGGCA-CCTT-CGGGTGTCAG-TGGCAGACGGGTGAGTAACACGTGGG-AACGTACCCTTCGGTTCGGAATAACTCAGGGAAACTTGATCTAATACCGGATACGCCCTTTT-GGGGAAAGGTTTA-CTGCCGAAAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTTGTTGGTGGGGTAACGGCCTACCAAGGCGATGATCAGTAGGTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACTTGGACTGAGACACGGCCCACACTCATACGGGA-GGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAATCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCTTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTCCGGGACGATAATGACGGTACCGGAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGGCTAGCGTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGCGCGTAGGCGGCCGATTAAGTCG-GGGGTGAAAGCCTGTGGC-TCAACCACAGAATTGCTTTCGATACTGGTTGGCTTGAGACCGGAAGAGGACAGCGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCAGTGGCG--AAGGCGGCTGTCTGGTCCGGTTCTGACGCTGAGGCGCGAAA-GCGTGGGGAGCACAACAGGATTAGACTACCGTGGTAGTACCACGCCGTAAGACGATGAATGCCAGCCGTTGGCCTGCTTGCAGGTCAGTGGCGCCGATAACGCATTAAGTATTCCGCGTGGGG-AGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAGAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTGGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCATCCCTTGACATGGCATG-TT-AC-CTCGAGAGATCGGG-GATCCTCTTCG-GAGGCGTGCACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCACGTCCTTAGTTGCCATCATTCAGTTGGGCACT?TAG-GGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGTGGATGTCGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACGGGATGGGCAACACACGTGC?ACAATGGCGGTGACAGTGGGACGCGAAGCCGCGAGGTGGAGCAAATCCCCAAAAACCGTCTCAGTTCGGATTGCACTCTGCAACTCGGGTGCATGAAGGCGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCACGCCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTTTACCCGACGGCGCTGCGCCAA--CCGCAA-GG--AGGCAGGCGACCACGGTAGGGT-CAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACC??????????????????????????????????? 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[1492] Methylobacterium_suomiense ????????????G-TTTGATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGG?TTAACACATGCAAGT?GAGCGG?C--CCTT-CGGG-GTCAG-CGGCAGACGGGTGAGTAACACGTGGG-AACGTGCCCTTCGGTTCGGAATAACTCAGGGAAACTTGAGCTAATACCGGATACGCCCTTTT-GGGGAAAGGTTTA-CCGC-GAA?GATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGGGGTAACGGCCT?CCAAGGCGACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGA-GGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCTTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTCCGGGACGATAATGACGGTACCGGAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGGCTAGCGTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGCGCGCAGGCGGCCGATTAAGTCG-GGGGTGAAAGCCTGTGGC-TCAACCACAGAATTGCCTTCGATACTGGTTGGCTTGAGACCGGAAGAGGACAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCAGTGGCG--AAGGCGGCTGTCTGGTCCGGTTCTGACGCTGAGGCGCGAAA-GCGTGGGGAGCA-AACAGGATTAGA-TACCCTGGTAGT-CCACGCCGTAA-ACGATGAATGCCAGCCGTTGGTCTGCTTGCAGGTCAGTGGCGCCGCTAACGCATTAAGCATTCCGCCTGGGG-AGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGGATTGACGGGGG-CCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCATCCCTTGACATGG?ATG-TT-AC-CT?CAGAGATCGGG-GATCCTCTTCG-GAGGCGTGCACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCACGTCCTTAGTTGCCATCATTCAGTTGGGCACTCTAG-GGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAGGTTGTGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACGGGATGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAGTGGGACGCGAAACCGCGAGGTTGAGCAAATCCCCAAAAGCCGTCTCAGTTCGGATTGCACTCTGCAACTCGGGTGCATGAAGGCGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTCTTACCCGACGGC?CTCC?CCAA--CCGCAC-GG--ACGCACGCGACCACGGCAGGGT-C??CCAC????????????????????????????????????????????????????????????? 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[1488] Xanthobacter_agilis ?????????????????????????????????????GCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGC-C--CAGC-AATG-G-GAG-CGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGG-GATCTACCCATTGGTACGGAATAACCCAGGGAAACTTGGACTAATACCGTATAAGCCCTTCG-GGGGAAAGATTTA-TCGCCAATGGATGAACCCGCGTCGGATTAGCTAGTTGGTGGGGTAAAGGCTCACCAAGGCGACGATCCGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGA-GGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCTTAGGGTTGTAAAGCTCTTTCGCCGGTGAAGATAATGACGGTAACCGGAGAAGAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGGCTAGCGTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGCGCACGTAGGCGGATCGTTAAGTCA-GGGGTGAAATCCTGGGGC-TCAACCTCAGAACTGCCCTTGATACTGGCGATCTCGAGTTCGAGAGAGGTTGGTGGAACTCCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGGAAGAACACCAGTGGCG--AAGGCGGCCAACTGGCTCGATACTGACGCTGAGGTGCGAAA-GCGTGGGGAGCA-AACAGGATTAGA-TACCCTGGTAGT-CCACGCCGTAA-ACGATGGATGCTAGCCGTTGGGAGGCTTGCCTTTCAGTGGCGCAGCTAACGCCTTAAGCATCCCGCCTGGGG-AGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCTTTGACATGGCAGGAC--GATTTCCAGAGATGGATCTCTTCCAGCAA-TGGACCTGCACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTCGCCCTTAGTTGCCATCATTCAGTTGGGCACTCTAA-GGGGACTGCCGGTGATAAGCCGAGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAGTGGGATGCGAGCCTGCGAGGGTGAGCAAATCTCCAAAAGCCGTCTCAGTTCGGATTGCACTCTGCAACTCGAGTGCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGCTTTACCCGAAGGCGCTGCGCTAACTCAGCAA-TGAGAGGCAGGCGACCACGGTAGGGT-CAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAACAA?????????????????????????????????????????? [1493] Xanthobacter_tagetidis ?????????????????????????????????????GCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGC-C--CAGC-AATG-G-GAG-CGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGG-GATCTGCCCTTTGGTACGGAATAACCCAGGGAAACTTGGACTAATACCGTATGTGCCCTTCG-GGGGAAAGATTTA-TCGCCAAAGGATGAACCCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGGGGTAATGGCCCACCAAGGCGACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGA-GGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGAAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCTTAGGGTTGTAAAGCTCTTTCGCCGGTGAAGATAATGACGGTAACCGGAGAAGAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGGCTAGCGTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGCGCACGTAGGCGGATCGTTAAGTCA-GGGGTGAAATCCTGGAGC-TCAACTCCAGAACTGCCCTTGATACTGGCGATCTCGAGTTCGAGAGAGGTTGGTGGAACTCCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGGAAGAACACCAGTGGCG--AAGGCGGCCAACTGGCTCGATACTGACGCTGAGGTGCGAAA-GCGTGGGGAGCA-AACAGGATTAGA-TACCCTGGTAGT-CCACGCCGTAA-ACGATGGATGCTAGCCGTTGGGGGGTTTACCTTTCAGTGGCGCAGCTAACGCCTTAAGCATCCCGCCTGGGG-AGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCTTTGACATGGCAGGAC--GACTTCCGGAGACGGATTTCTTCCAGCAA-TGGACCTGCACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTCGCCTCTAGTTGCCAGCATTAAGTTGGGCACTCTAG-AGGGACTGCCGGTGATAAGCCGAGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGTGGTGACAGTGGGATGCAAAAGGGCGACCTCTAGCAAATCTCCAAAAGCCATCTCAGTTCGGATTGCACTCTGCAACTCGAGTGCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGCTTTACCCGAAGGCGCTGCGCTAAC-CCGCAA-GG-GAGGCAGGCGACCACGGTAGGGT-CAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAACAA?????????????????????????????????????????? [1491] Rhodomicrobium_vannielii ?CAAAATCTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAACGCA---CCGC-AAGG--TGAG-TGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGG-AACCTTCCCTTTGGTACGGAATAACTTCGGGAAACCGAAGCTAATACCGTATATCTCCTCCG-GGAGAAAGATTTA-TCGCCAAAGGATGGGCCCGCGTTGGATTAGCTAGTTGGTGTGGTAACGGCGCACCAAGGCGACGATCCATAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGA-GGC?GC?GTGGGGAATCTTGGACAATGGGGGCAACCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGAAGAAGGCCTTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGGCGGGGACGATAATGACGGTACCCGCAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGGC?AGCGTTGTTCGGAATCACTGGGCGTAAAGCGTACGCAGGCGGATTGATAAGTCA-GGGGTGAAATCCCGGGGC-TCAACCTCGGAATTGCCTTTGATACTGTCTGTCTCGAGTTCGGGAGAGGTTGGCGGAATTCCTAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTAGGAAGAACACCAGTGGCG--AAGG??GCCAACTGGCCCGATACTGACGCTCATGTACGAAA-GCGTGGGGAGCA-AACAGGATTAGA-TACCCTGGTAGT-CCACGCTGTAA-ACTATGGATGCTAGCCGTTGGGGAGCTTGCTCTTCAGTGGCGCAGCTAACGTCTTAAGCATCCCGCCTGGGG-AGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAGGCAACGCGAAGAACCTTACCAGCTCTTGACATGTCGTG-C--TACGTGGAGAGATTCAC-GGTTCCCTTCG-GGGACGCGAACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTCGCCCTTAGTTGCTACCATTTAGTTGAGCACTCTAA-GG??ACCGCCGGTGATAAGCCG-GAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAGTGGGCAGCGACACAGCGATGTGATGCTAATCCCAAAAAGCCGTCTCAGTTCAGATTGCACTCTGCAACTCGAGTGCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGCCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTTTACCCGAAGGCGT?A?GCTAA--CCG??????????????????????????????????????????????????GTAACAAG????????????GAACCTG??????GATCACCTCCTTTCT? [1490] Pedomicrobium_australicum ?????????????????GATCCTGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGC-CG-TAGC-AATACG-GAG-TGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGG-AACCTACCTTACGGTCGGGAATAGCTCAGGGAAACTTGGGGTAATACCGGATACGCCCTTAC-GGGGAAAGATTTA-TCGCCGTTAGATGGGCCCGCGTAGGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGCGACGATCCTTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGA-GGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGACGAAGGCCTTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGGCGGGGAAGATAATGACGGTACCCGCAGAATAAGCTCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGAGCTAGCGTTGTTCGGAATCACTGGGCGTAAAGCGCACGTAGGCGGATGTGTCAGTCA-GGGGTGAAATCCCGGAGC-TCAACTTCGGAACTGCCCTTGATACAACACGTCTTGAGTCCGAGAGAGGTGAGTGGAATTCCTAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTAGGAAGAACACCGGTGGCG--AAGGCGGCTCACTGGCTCGGTACTGACGCTGAGGTGCGAAA-GCGTGGGGAGCA-AACAGGATTAGA-TACCCTGGTAGT-CCACGCTGTAA-ACGATGGATGCTAGCCGTCAGCAAGCATGCTTGTTGGTGGCGCAGCTAACGCATTAAGCATCCCGCCTGGGG-AGTACGGCCGCAAGGTTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGACGCAACGCGAAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGCCCGGAC--GGTTTCCAGAGATGGATTCCTCCTAGCAA-TAGGTCGGGACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTCGCCATTAGTTGCCCTTATTAAGTTAGGCACTCTAG-TGGGACTGCCGGTGATAAGCCG-GAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAGTGGGCAGCCACCCAGCGATGGGCAGCTAATCCCAAAAAGCCGTCTCAGTTCGGATTGGAGTCTGCAACTCGACTCCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCAGATCAGCACGCTGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTTTACCCGAAGACGGTGCGCTAA--CCGCAA-GG--AGGCAGCCGGCCACGGTAAGGT-CAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGG??????????????????? [1490] Hyphomicrobium_facile_subsp_tolerans ?????????????????????????????????GAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAACGC-C--CCGC-AAGG-G-GAG-TGGCAGACGGGTGAGTAACACGTGGG-AACCTTCCCTATAGTACGGAATAGCCCAGGGAAACTTGGAGTAATACCGTATACGCCCGAAA-GGGGAAAGAATTT-TCGCTATAGGATGGGCCCGCGTAGGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGCGACGATCCTTAGCTGGTTTGAGAGAACGACCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGA-GGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCTTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGCCGGGGACGATAATGACGGTACCCGGAGAATAAGTCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGACTAGCGTTGTTCGGAATCACTGGGCGTAAAGCGCACGTAGGCGGATTTGTAAGTCA-GGGGTGAAATCCCGGGGC-TCAACCTCGGAACTGCCTTTGATACTGCGAATCTTGAGTCCGATAGAGGTGGGTGGAATTCCTAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTAGGAAGAACACCGGTGGCG--AAGGCGGCCCACTGGATCGGTACTGACGCTGAGGTGCGAAA-GCGTGGGGAGCA-AACAGGATTAGA-TACCCTGGTAGT-CCACGCCGTAA-ACGATGGATGCTAGCCGTCGGATAGCTTGCTATTCGGTGGCGCAGCTAACGCATTAAGCATCCCGCCTGGGG-AGTACGGCCGCAAGGTTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGACGCAACGCGAAGAACCTTACCAGCTCTTGACATTCACTGAT--CGCCTGGAGAGATCCGGGAATTCCAGCAA-TGGACAGTGGGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTCGCCATTAGTTGCCATCATTTAGTTGGGCACTCTAG-TGGGACTGCCGGTGATAAGCCG-GAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGCGCAGCCACCTAGCAATAGGGAGCTAATCGCAAAAAGCCGTCTCAGTTCAGATTGAGGTCTGCAACTCGACCTCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCGCATCAGCATGGCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTCTTACCCTAAAACGGTGCGCTAA--CCGCAA-GG--AGGCAGCCGGCCACGGTAAGGT-CAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTA???????????????????????????????? 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[1491] Blastochloris_sulfoviridis ??????????????????????????????AGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAGCGCCCG-TAGC-AATACG-GAG-CGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGG-AACGTGCCCTAAGGTACGGAACAACCAAGGGAAACTTTGGCTAATACCGTATGTGCCCGAGA-GGGGAAAGATTTA-TCGCCTTAGGAGCGGCCCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGGCGACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGA-GGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCTTAGGGTTGTAAAGCTCTTTCGACGGGGAAGATAATGACGGTACCCGTAGAAGAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGGCTAGCGTTGCTCGGATTTACTGGGCGTAAAGCGCACGTAGGCGGGTCGTTAAGTCG-GGGGTGAAATCCCGGAGC-TCAACTCCGGAACTGCCTTCGATACTGGCGATCTCGAGTCCGGGAGAGGTGAGTGGAATTCCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGGAAGAACACCAGTGGCG--AAGGCGGCTCACTGGCCCGGTACTGACGCTGAGGTGCGAAA-GCGTGGGGAGCA-AACAGGATTAGA-TACCCTGGTAGT-CCACGCCGTAA-ACGATGGAGGCTAGCCGTTGGTGAGCATGCTCATCAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCCTCCCGCCTGGGG-AGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCTCTTGACATGCCACGAC--GGTTTCCAGAGATGGACTCTTTCCCGCAA-GGGACGTGGACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTCGCCCTTAGTTGCCATCATTCAGTTGGGCACTCTAA-GGGGACTGCCGGTGATAAGCCGAGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAGTGGGCAGCGAAGGGGCGACCCTAAGCTAATCTCCAAAAGCCGTCTCAGTTCGGATTGCACTCTGCAACTCGAGTGCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCAGATCAGCATGCTGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGCTTTACCCGAAGGCGATGCGCTAA--CCGCAA-GG--GGGCAGTCGACCACGGTAGGGT-CAGCGACTGGGGTG?????????????????????????????????????????????????????? [1492] Rhodoplanes_elegans ??????????????????????????????AGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAGCGC-C--CCGC-AAGG-G-GAG-CGGCAGACGGGTGAGTAACACGTGGG-AACGTACCCTTTGGTTCGGAACAACCCAGGGAAACTTGGGCTAATACCGGATAAGTCCGCGA-GGAGAAAGATTTA-TCGCCGAAGGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGTGGTAACGGCGCACCAAGGCGACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGA-GGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGGGCAACCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTCGGTGGGGAAGATAATGACGGTACCCACAGAAGAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGGCTAGCGTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGCGCACGTAGGCGGCTTTCTAAGTCA-GGGGTGAAATCCCGGAGC-TCAACTCCGGAACTGCCTTTGATACTGGGAGGCTCGAGTCCGGGAGAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCAGTGGCG--AAGGCGGCTCACTGGCCCGGTACTGACGCTGAGGTGCGAAA-GCGTGGGGAGCA-AACAGGATTAGA-TACCCTGGTAGT-CCACGCCGTAA-ACGATGGATGCTAGCCGTTGGCGAGCTTGCTCGTCAGTGGCGCAGCTAACGCCTTAAGCATCCCGCCTGGGG-AGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCTCTTGACATGCCACGAC--GGTTTCCGGAGACGGACTCCTCCCCGCAA-GGGGCGTGGACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTCGCCCTTAGTTGCCACCATTCAGTTGGGCACTCTAA-GGGGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAGTGGGACGCGAAGGGGTGACCCTTAGCAAATCTCAAAAAGCCGTCTCAGTTCGGATTGGGCTCTGCAACTCGAGCCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGCAGATCAGCACGCTGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGCTTTACCTGAAGGCGTTGCGCTAAC-CCGCAA-GG-GAGGCAGGCGACCACGGTAGGGT-CAGCGACTGGGGTG?????????????????????????????????????????????????????? [1491] Rhodoplanes_roseus ??????????????????????????????AGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAGCGCCCG-TAGC-AATACGGGAG-CGGCAGACGGGTGAGTAACACGTGGG-AACGTACCCTTTGGTTCGGAACAACCCAGGGAAACTTGGGCTAATACCGGATAAGTCCGCGA-GGAGAAAGATTTA-TCGCCGAAGGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGTGGTAACGGCGCACCAAGGCGACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGA-GGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGGGAAACCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCTTAGGGTTGTAAAGCTCTTTCAGTGGGGAAGATAATGACGGTACCCACAGAAGAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGGCTAGCGTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGCGCACGTAGGCGGCTTTCTAAGTCA-GGGGTGAAATCCCGGAGC-TCAACTCCGGAACTGCCCTTGATACTGGAGAGCTCGAGTCCGGGAGAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCAGTGGCG--AAGGCGGCTCACTGGCCCGGTACTGACGCTGAGGTGCGAAA-GCGTGGGGAGCA-AACAGGATTAGA-TACCCTGGTAGT-CCACGCCGTAA-ACGATGGATGCTAGCCGTTGGGCAGCTTGCTGCTCAGTGGCGCAGCTAACGC?TTAAGCATCCCGCCTGGGG-AGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTCAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCTCTTGACATGCCACGAC--GGTTTCCGGAGACGGACTCCTCCCCGCAA-GGGGCGTGGACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTCGCCCTTAGTTGCCATCATTCAGTTGGGCACTCTAA-GGGGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAGTGGGACGCGAAGGGGCAACCCTTAGCAAATCTCAAAAAGCCGTCTCAGTTCGGATTGGGGTCTGCAACTCGACCCCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCAGATCAGCACGCTGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTTTACCTGAAGGCGCTGCGCTAACTCAGCAA-TGAGAGGCAGGCGACCACGGTAGGGT-CAGCGACTGGGGTG?????????????????????????????????????????????????????? [1497] Methylocystis_parvus ??????????????????????????????AACGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGC-TG-TAGC-AATACA-GAG-TGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGG-AACGTGCCTTTCGGTTCGGAATAACTCAGGGAAACTTGAGCTAATACCGGATACGCCCTTTG-GGGGAAAGATTTA-TTGCCGAAAGATCGGCCCGCGTCCGATTAGCTAGTTGGTGTGGTAATGGCGCACCAAGGCGACGATCGGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGA-GGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTCGCCAGGGACGATAATGACGGTACCTGGATAAGAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGGCTAGCGTTGTTCGGAATCACTGGGCGTAAAGCGCACGTAGGCGGATCTTTAAGTCA-GGGGTGAAATCCCGAGGC-TCAACCTCGGAACTGCCTTTGATACTGGAGGTCTCGAGTCCGGGAGAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCAGTGGCG--AAGGCGGCTCACTGGCCCGGTACTGACGCTGAGGTGCGAAA-GCGTGGGGAGCA-AACAGGATTAGA-TACCCTGGTAGT-CCACGCCGTAA-ACGATGGATGCTAGCCGTTGGGGAGCATGCTCTTCAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATCCCGCCTGGGG-AGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCTTTTGACATGCCCGGTAT-GATCGCCAGAGATGGCTTTCTTCCCGCAA-GGGGCCGGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTCGCCCTTAGTTGCCATCATTCAGTTGGGCACTCTAG-GGGGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACAGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGAAGCGAAAGGGCGACCTGGAGCAAATCTCAAAAAGCCGTCTCAGTTCGGATTGCACTCTGCAACTCGAGTGCATGAAGGTGGAATCGCTAGTAATCGCAGATCAGCACGCTGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTTTACCCGAAGGCGTTTCGCCAA--CCGCAA-GG--AGGCAGGCGACCACGGTAGGGT-CAGCGACTGGGGTG?????????????????????????????????????????????????????? [1492] Methylosinus_sporium ??????????????????????????????AACGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAACGC-TG-TAGC-AATACA-GAG-TGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGG-AACGTGCCTTTCGGTTCGGAATAACTCAGGGAAACTTGAGCTAATACCGGATACGCCCTTCG-GGGGAAAGATTTA-TTGCCGAAAGATCGGCCCGCGTCCGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGCGACGATCGGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGA-GGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTCGCCAGGGACGATAATGACGGTACCTGGATAAGAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGGCTAGCGTTGTTCGGAATCACTGGGCGTAAAGCGCACGTAGGCGGATCTTTAAGTCA-GGGGTGAAATCCCGAGGC-TCAACCTCGGAACTGCCTTTGATACTGGAGGTCTAGAGTCCGGGAGAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCAGTGGCG--AAGGCGGCTCACTGGCCCGGAACTGACGCTGAGGTGCGAAA-GCGTGGGGAGCA-AACAGGATTAGA-TACCCTGGTAGT-CCACGCCGTAA-ACGATGGATGCTAGCCGTTGGGCAGCTTGCTGTTCAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATCCCGCCTGGGG-AGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCTTTTGACATGTCTAGTAT-GGTCGACAGAGATGTCTTCCTTCCCGCAA-GGGGCTAGAACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTCGCCCTTAGTTGCCATCATTCAGTTGGGCACTCTAG-GGGGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACAGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGACGCGAAGGGGCGACCCTTAGCAAATCTCAAAAAACCGTCTCAGTTCGGATTGCACTCTGCAACTCGAGTGCATGAAGGTGGAATCGCTAGTAATCGCAGATCAGCACGCTGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGCTTTACCCGAAGGCGTTTCGCTAA--CCGCAA-GG--AGGCAGACGACCACGGTAGGGT-CAGCGACTGGGGTG?????????????????????????????????????????????????????? [1492] Rhodoblastus_acidophilus ?TACAACTTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAACGGGCA-TAGC-AATATGTCAG-TGGCAGACGGGTGAGGAACACGTGGG-AACATGCCCTTTGGTTCGGAACAACTCAGGGAAACTTGAGCTAATACCGGATAAGCCTTTCG-AGGGAAAGATTTA-TCGCCGAAGGAGTGGCCCGCGTCCGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGCGACGATCGG?AGCT?GTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTACGGGA-GGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCC?GATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGATGACGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTCACCCACGACGATAATGACGGTAGTGGGCGAAGAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGGC?AGCGTTGTTCGGATTTACTGGGCGTAAAGCGCACGTAGGC?GATCTTTAAGTCA-GGGGTGAAATGCCGGAGC-TCAACTTCGGAACTGCCTTTGATACTGGAGATCTTGAGTTCGAGAGAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCAGTGGCG--AAGGCGGCTCACTGGCTCGATACTGACGCTGAGGTGC??AA-GCGTGGGGAGCA-AACAGGATTAGA-TACCCTGGTAGT-CCACGCCGTAA-ACGATGGATGCTAGCCGTTAGGCAGCTTGCTGCTTAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATCCCGCCTGGGG-AGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGC?CGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCTTTTGACATGTCTTGGAC-GGATAGCAGAGATGTTATC-TTCTCTTCG-GAGCCGAGAACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTC?GCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCACGTCCTTAGTTGCCATCATTAAGTTGGGCACTCTAG-GGAGACTGCCGGTGATAAGCCGAGAGGAAGGTGTGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACAGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGAAGCGAAAGGGCGACCTCTAGCAAATCTCAAAAAACCGTCTCAGTTCGGATTGTACTCTGCAACTCGAGTGCATGAAGGTGGAATCGCTAGTAATCGCAGATCAGAACGCTGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGCTTTACCCGAAGGCGTTTCGCTAA--CCGCAA-GG--AGGCAGGCGACCACGGTAGGGT-CAGCG?CT?GG????????GTAACAAG????????????GAACCTG??????GATCACCTCCTTTCT? [1493] Beijerinckia_indica ??TTAACTTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGC-TG-TAGC-AATACG-GAG-TGGC??ACGGGTGAGTAACACGTGGG-AACATACCCTTTGGTTCGGAATAACTCAGGGAAACTTGGGCTAATACCGGATACGCCCTACG-GGGGAAAGATTTA-TTGCCGAAGGATTGGCCCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAA?GGCTCAC?AAGGCGACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTACGGGA-GGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCTTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTACCTGGGAAGATAATGACGGTACCAGGAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGC?GCGGT?ATACGAAGGGGGCTAGCGTTGTTCGGATTTACTGGGCGTAAAGCGCACGTAGGCGGATCTTTAAGT?A-GGGGTGAAATCCCAAGGC-TCAACCTTGGAACTGCCTTTGATACTGGGGATCTCGAGTCCGGGAGAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCAGTGGCG--AAGGCGGCTCACTGGCCCGGTACTGACGCTGAGGTGCGAAA-GCGTGGGGAGCA-AACAGGATTAGA-TACCCTGGTAGT-CCACGCCGTAA-ACGATGGATGCTAGCCGTTAGGCAGCTTGCTGCTTAGTGGCGCAGTTAACGCTTTAAGCATCCCGCCTGGGG-AGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTG?CGGGGGCC?GCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAA??AACGCGCAGAACCTTACCAACCTTTGACATGTCTCGTTT-GGTTACCAGAGATGGTTTCCTTCAGTTAGGCTGGCGAGAACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCACGCCCTTAGTTGCCATCATTCAGTTGGGCACTCTAG-GGGGACTGC?GGTGATAAGCCGAGAGGAAGGTGTGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACGGGTTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGA?GCGAAGGGGCG?CCCTCAGCAAATCTCAAAAAGCCGTCTCAGTTCGGATTGTACTCTGCAACTCGAGTGCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTAGATCAGAACGCTACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTCTACCCGAAGGCGTTTTGCTAA--CCGCAA-GG--GGGCA?GCGACCACGGTAGGGT-CAGCGAC??GGG???????????????????????????????????????????????????????? [1493] Methylocapsa_acidiphila_B2 ?????????????GTTTGATCCTGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGC-C--CCGC-AAGG-G-GAG-TGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGG-AACATACCCTTCGGTTCGGAATAGCTCAGGGAAACTTGGATTAATACCGGATACGTCCGCAA-GGAGAAAGATTTA-TCGCCGAAGGATTGGCCCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGCGACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTACGGGA-GGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGAAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCTTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTACCTGGGAAGATAATGACGGTACCAGGAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGGCTAGCGTTGTTCGGATTTACTGGGCGTAAAGCGCACGTAGGCGGATCTTTAAGTCA-GGGGTGAAATCCCGGGGC-TCAACCTCGGAACTGCCTTTGATACTGGAGATCTTGAGTTCGGGAGAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCAGTGGCG--AAGGCGGCTCACTGGCCCGATACTGACGCTGAGGTGCGAAA-GCGTGGGGAGCA-AACAGGATTAGA-TACCCTGGTAGT-CCACGCCGTAA-ACGATGGATGCTAGCCGTTAGGCAGCTTGCTGCTTAGTGGCGCAGTTAACGCTTTAAGCATCCCGCCTGGGG-AGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCTCTTGACATGCCTTGGAC-GGTTACCAGAGATGGTTTCC-TCTCTTCG-GAGCCAGGGACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTCGCCCTTAGTTGCCATCATTTAGTTGGGCACTCTAG-GGGGACTGCCGGTGATAAGCCGAGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGACGCAAAGGGGTGACCCCTAGCAAATCTCAAAAAGCCGTCTCAGTTCGGATTGCACTCTGCAACTCGAGTGCATGAAGGTGGAATCGCTAGTAATCGTAGATCAGAACGCTACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTCTACCCGAAGGCGTTTTGCTAA--CCGCAA-GG--GGGCAGGCGACCACGGTAGGGT-CAGCGAC????????????????????????????????????????????????????????????? [1489] Methylocella_palustris ??????????????????????????????AACGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGC-C--CCGC-AAGG-G-GAG-TGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGG-AACATACCCTTCGGTTCGGAATAGCTCAGGGAAACTTGGATTAATACCGGATACGTCCGCAA-GGAGAAAGATTTA-TCGCCGAAGGATTGGCCCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAACGGCCCACCAAGGCGACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTACGGGA-GGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCTTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTACCTGGGAAGATAATGACGGTACCAGGAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGGCTAGCGTTGTTCGGATTTACTGGGCGTAAAGCGCACGTAGGCGGATCTTTAAGTCA-GAGGTGAAATGCCGGGGC-TCAACCCCGGAACTGCCTTTGATACTGGGGATCTCGAGTCCGGGAGAGGTGAGCGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCAGTGGCG--AAGGCGGCTCACTGGCCCGGTACTGACGCTGAGGTGCGAAA-GCGTGGGGAGCA-AACAGGATTAGA-TACCCTGGTAGT-CCACGCCGTAA-ACGATGGATGCTAGCCGTTAGGCAGCTTGCTGCTTAGTGGCGCAGTTAACGCTTTAAGCATCCCGCCTGGGG-AGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCTCTTGACATGTCTCGTAT-GGTTTCCAGAGATGGATTCCTTCACTTCGGGTGGCGAGAACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTCGCCCCTAGTTGCCATCATTCAGTTGGGCACTCTAG-GGGGACTGCCGGTGATAAGCCGAGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAGTGGGATGCGGAGGGGCGACCCCGAGCAAATCTCAAAAAGCCGTCTCAGTTCGGATTGCACTCTGCAACTCGAGTGCATGAAGGTGGAATCGCTAGTAATCGTAGATCAGAACGCTACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTCTACCCGAAGGCGTTTTCTTAA--CCGCAA-GG--AGAGAGGCGACCACGGTAGGGT????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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[1496] Pseudomonas_carboxydohydrogena ???????????????????????????????GCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAGCGC-CG-TAGC-AATACG-GAG-AGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGG-AACGTACCTTTTGGTTCGGAACAACACAGGGAAACTTGTGCTAATACCGAATAAG?CCTTAC-GGGGAAAGATTTA-TCGCCGAAAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTTGTTGGTGAGGTAACGGCTCAC?AAGGCGACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTACGGGA-GGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGAAGATAATGACGGTACCGCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGGCTAGCGTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTCTTTAAGTCA-GAGGTGAAAGCCTGGAGC-TCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTGAGGATCTCGAGTTCGGGAGAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCAGTGGCG--AAGGCGGCTCACTGGCCCGATACTGACGCTGAGGCACGAAA-GCGTGGGGAGCA-AACAGGATTAGA-TACCCTGGTAGT-CCACGCCGTAA-ACGATGAATGCCAGCCGTTGGAAAGTTTACTTTTCAGTGGCGCAGTTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGG-AGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAAGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGACGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCCAGGACCGG-TCGCAGAGATGTGA-CCTTCTCTTCG-GAGCCTGGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTACCATTTAGTTGAGCACTCTAA-GGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGATGCAAAGGCGCGAGCCCTAGCAAATCTCAAAAAGCCGTCTCAGTTCGGATTGGACTCTGCAACTCGAGTCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTTTACCTGAAGACGGTGCGCTAAC-CCGCAA-GG--AGGCAGCCGGCCACGGTAGGGT-CAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCAC?????????? [1492] Oligotropha_carboxidovorans ???????TGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAACGGGCG-TAGC-AATACGTCAG-TGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGG-AACGTACCTTTTGGTTCGGAACAACACAGGGAAACTTGTGCTAATACCGGATAAGCCCTTAC-GGGGAAAGATTTA-TCGCCGAAAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGGCGACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTACGGGA-GGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGAAGATAATGACGGTACCGCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGGCTAGCGTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTCTTTAAGTCA-GAGGTGAAAGCCTGGAGC-TCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTGAGGATCTTGAGTTCGGGAGAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCAGTGGCG--AAGGCGGCTCACTGGCCCGATACTGACGCTGAGGCACGAAA-GCGTGGGGAGCA-AACAGGATTAGA-TACCCTGGTAGT-CCACGCCGTAA-ACGATGAATGCCAGCCGTTGGAAAGTTTACTTTTCAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGG-AGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGACGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCCAGGACCGG-TCGCAGAGATGTGA-CCTTCTCTTCG-GAGCCTGGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTACCATTTAGTTGAGCACTCTAA-GGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGATGCAAAGGCGCGAGCCCTAGCAAATCTCAAAAAGCCGTCTCAGTTCGGATTGGGCTCTGCAACTCGAGCCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTTTACCTGAAGACGGTGCGCTAAC-CCGCAA-GG-GAGGCAGCCGGCCACGGTAGGGT-CAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTA??? [1495] Afipia_broomeae ?????????????ATTTGATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAGCGGGCG-TAGC-AATACGTCAG-CGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGG-AACGTACCTTTTGGTTCGGAACAACACAGGGAAACTTGTGCTAATACCGGATAAGCCCTTAC-GGGGAAAGATTTA-TCGCCGAAAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGGCGACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTACGGGA-GGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGAAGATAATGACGGTACCGCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGGCTAGCGTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTCTTTAAGTCA-GGGGTGAAATCCTGGAGC-TCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTGAAGATCTTGAGTTCGGGAGAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCAGTGGCG--AAGGCGGCTCACTGGCCCGATACTGACGCTGAGGCACGAAA-GCGTGGGGAGCA-AACAGGATTAGA-TACCCTGGTAGT-CCACGCCGTAA-ACGATGAATGCCAGCCGTTGGAAAGTTTACTTTTCAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGG-AGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGACGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCTATGACCGG-TACCAGAGATGGAA-CCTTCCCTTCG-GGGCATAGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTACCATTTAGTTGAGCACTCTAA-GGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGACGCTAAGGGGCAACCCTTCGCAAATCTCAAAAAGCCGTCTCAGTTCGGATTGGGCTCTGCAACTCGAGCCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTTTACCTGAAGACCGTGCGCTAA--CCGAAA-GG--GGGCAGCCGGC???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? [1494] Bosea_thiooxidans ???????????GAGTTTGATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAACGGGCA--CTT-CGG-TGCTAG-TGGCAGACGGGTGAGTAACACGTGGG-AACGTACCTTTCGGTTCGGAATAACTCAGGGAAACTTGAGCTAATACCGGATACGCCCTTCG-GGGGAAAGATTTA-TCGCCGATAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGCGACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTACGGGA-GGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCTTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTCCGGGAAGATAATGACTGTACCGGAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGGCTAGCGTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGCGCGTAGGCGGACTCTTAAGTCG-GGGGTGAAAGCCCAGGGC-TCAACCCTGGAATTGCCTTCGATACTGGGAGTCTTGAGTTCGGAAGAGGTTGGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCAGTGGCG--AAGGCGGCCAACTGGTCCGATACTGACGCTGAGGCGCGAAA-GCGTGGGGAGCA-AACAGGATTAGA-TACCCTGGTAGT-CCACGCCGTAA-ACGATGAATGCCAGCCGTTGGGGAGCATGCTCTTCAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGG-AGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCTTTTGACATGTCCGGTTT-GATCGGCAGAGATGCCTTTCTTCAGTTCG-GTGGCCGGAACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTCGCCCCTAGTTGCCATCATTCAGTTGGGAACTCTAG-GGGGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACAGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGCAGCGAAAGGGCGACCTCGAGCTAATCCCAAAAAGCCGTCTCAGTTCAGATTGTACTCTGCAACTCGAGTACATGAAGGTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGGTTTACCCGAAGGCGTCGCGCTAA--CCGCAA-GG--AGGCAGGCGACCACGGTAGGCT-CAGCGACTGGGGTGAATTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCT????????????????? [1492] Methylobacterium_rhodinum ??????????????????????????????AGCGAACGCTGTCGGCAGGCTTATCACATGTAAGTCGAGAGGGCA-CCTT-CGGGTGTCAG-CGGCAGACGGGTGAGTAACACGTGGG-AACGTGCCCTTCGGTTCGGAATAACTCAGGGAAACTTGAGCTAATACCGGATACGCCCTTAT-GGGGAAAGGTTTA-CCGCCGAAGGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTTGTTGGTGGGGTAACGGCCTACCAAGGCGACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATCATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGA-GGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCTTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTCCGGGACGATAATGACGGTACCGGAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGGCTAGCGTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGCGCGTAGGCGGCTTTTTAAGTCG-GGGGTGAAAGCCTGTGGC-TCAACCACAGAATTGCCTTCGATACTGGAAAGCTTGAGACCGGAAGAGGACAGCGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCAGTGGCG--AAGGCGGCTGTCTGGTCCGGTTCTGACGCTGAGGCGCGAAA-GCGTGGGGAGCA-AACAGGATTAGA-TACCCTGGTAGT-CCACGCCGTAA-ACGATGAATGCCAGCCGTTGGCCTGCTTGCAGGTCAGTGGCGCCGCTAACGCATTAAGCATTCCGCCTGGGG-AGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCATCCCTTGACATGGCGTGT---TACCCAGGGAGACTTGG-GATCCTCTTCG-GAGGCGCGCACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCACGTCCTTAGTTGCCATCATTCAGTTGGGCACTCTAG-GGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGTGGATGACGTCAAGTCCTCATGGGCCTTACGGGATGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAGTGGGACGCGAAGGAGCGATCTGGAGCAAATCCCCAAAAGCCGTCTCAGTTCGGATTGCACTCTGCAACTCGGGTGCATGAAGGCGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTCTTACCCGACGGCGCTGCGCCAA--CCGCAA-GG--AGGCAGGCGACCACGGTAGGGT-CAGCGACTGGGGTG?????????????????????????????????????????????????????? [1491] Methylobacterium_rhodesianum ??????????????????????????????AGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAGCGGGCA-CCTT-CGGGTGTCAG-CGGCAGACGGGTGAGTAACACGTGGG-AACGTGCCCTTCGGTTCGGAATAACTCAGGGAAACTTGAGCTAATACCGGATACGCCCTTTT-GGGGAAAGGTTTA-CTGCCGAAGGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTTGTTGGTGGGGTAACGGCCTACCAAGGCGACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCA?ACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGA-GGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCGTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGATGAAGACCTTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTCCGGGACGATAATGACGGTACCGGAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGGCTAGCGTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGCGCGTAGGCGGCCGATTAAGTCG-GGGGTGAAAGCCTGTGGC-TCAACCACAGAATTGCCTTCGATACTGGTTGGCTTGAGACCGGAAGAGGACAGCGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACGAGTGGCG--AAGGCGGCTGTCTGGTCCGGTTCTGACGCTGAGGCGCGAAA-GCGTGGGGAGCA-AACAGGATTAGA-TACCCTGGTAGT-GGACGCCGTAA-ACGATGAATGCCAGCCGTTGGTCTGCTTGCAGGTCAGTGGCGCCGCTAACGCATTAAGCATTCCGCCTGGGG-AGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCATCCCTTGACATGGCATGT---TACCTCGAGAGATCGGG-GATCCTCTTCG-GAGGCGTGCACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCACGTCCTTAGTTGCCATCATTCAGTTGGGCACTCTAG-GGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGTGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACGGGATGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAGTGGGACGCGAAACCGCGAGGTTGAGGGAATCCCCAAAAGCCGTCTCAGTTCGGATTGCACTCTGCAACTCGGGTGCATGAAGGCGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCACGCCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTCTTACCCGACGGCGCTGCGCCAA--CCGCAA-GG--AGGCAGGCGACCACGGTAGGGT-CAGCGACTGGGGTG?????????????????????????????????????????????????????? [1491] [ [ ambiguous region ] [ 71-76 86-90 195-196 1428-1431 ] 5005c2 ???? 5005c4 ???? 5005c5 ???? 5006c11 ???? 5006c12 ???? 5012c18 ???? 5012c19 ???? 5012c24 ???? 5015c31 ???? 5018c33 ???? 5018c35 ???? 5018c37 ???? 5018c39 ???? 5025c41 ???? 5025c43 ???? 5025c44 ???? 5026c52 ???? 5027c58 ???? 5027c61 ???? 5028c69 ???? 5028c71 ???? 5033c76 ???? 5036c84 ???? 5038c90 ???? 5038c94 ???? uncultured_Methylobacteriaceae_bacterium ???? uncultured_bacterium_FD01A08 ???? uncultured_bacterium ???? uncultured_alpha_proteobacterium_BPU225 ???? uncultured_bacterium_nbw397h09c1 ???? uncultured_bacterium_FD02D06 ???? uncultured_alpha_proteobacterium_SOL7_1 ???? uncultured_bacterium_Sed3 ???? uncultured_bacterium_nbu176h08c1 ???? uncultured_bacterium_5C231311 ???? uncultured_bacterium_FD04E06 ???? Beijerinckia_derxii 4804 Beijerinckia_mobilis_DSM_2326 6304 Afipia_felis F50? Methylobacterium_podarium_strain_FM3 H001 Mycoplana_dimorpha 3601 Brucella_melitensis_16M 3601 Ochrobactrum_anthropi 3601 Bartonella_bacilliformis 1B01 Rhizobium_leguminosarum 3601 Sinorhizobium_meliloti_1021 3601 Mesorhizobium_amorphae 3601 Phyllobacterium_myrsinacearum 3601 Methylobacterium_adhaesivum_DSM_17169 DH04 Methylobacterium_persicinum_002_165 DH05 Methylobacterium_komagatae_002_079 EH05 Methylocystis_echinoides 4801 Methylosinus_trichosporium F501 Methylosinus_acidophilus 7201 Methylobacterium_populi_BJ001 H004 Methylobacterium_thiocyanatum H004 Methylobacterium_lusitanum H53? Methylobacterium_zatmanii DH?? Methylobacterium_chloromethanicum_CM4 DH01 Methylobacterium_aminovorans DH01 Methylobacterium_suomiense ?900 Methylobacterium_extorquens DH01 Methylobacterium_aquaticum B911 Methylobacterium_nodulans_ORS_2060 B934 Methylobacterium_fujisawaense 8901 Methylobacterium_variabile EH24 Methylobacterium_radiotolerans_JCM_2831 9D01 Methylobacterium_mesophilicum DH21 Methylobacterium_hispanicum 2101 Methylobacterium_organophilum 2101 Starkeya_novella_DSM_506 0E03 Ancylobacter_aquaticus 3703 Angulomicrobium_tetraedale 3603 Xanthobacter_autotrophicus 3603 Azorhizobium_caulinodans_ORS_571 3601 Xanthobacter_agilis 3602 Xanthobacter_tagetidis 3603 Rhodomicrobium_vannielii 0E0? Pedomicrobium_australicum 6301 Hyphomicrobium_facile_subsp_tolerans 3641 Hyphomicrobium_zavarzinii 7201 Hyphomicrobium_hollandicum 7201 Prosthecomicrobium_pneumaticum 3601 Blastochloris_viridis 6304 Blastochloris_sulfoviridis 5304 Rhodoplanes_elegans 3603 Rhodoplanes_roseus 5402 Methylocystis_parvus 7201 Methylosinus_sporium 7201 Rhodoblastus_acidophilus DH01 Beijerinckia_indica 7304 Methylocapsa_acidiphila_B2 3604 Methylocella_palustris 3601 Chelatococcus_asaccharovorans 2B0? Nitrobacter_alkalicus F503 Nitrobacter_winogradskyi F501 Nitrobacter_hamburgensis_X14 F501 Bradyrhizobium_elkanii DH04 Bradyrhizobium_lupini F503 Bradyrhizobium_japonicum F503 Blastobacter_denitrificans F503 Rhodopseudomonas_palustris F506 Pseudomonas_carboxydohydrogena 6301 Oligotropha_carboxidovorans F503 Afipia_broomeae F504 Bosea_thiooxidans DF01 Methylobacterium_rhodinum DH01 Methylobacterium_rhodesianum DH01 ] ; END; BEGIN ASSUMPTIONS; [ USERTYPE FULL16S STEPMATRIX = 5 A C G T - [A] . 2.01 1.66 2.03 4.13 [C] 2.01 . 1.91 1.59 4.06 [G] 1.66 1.91 . 2.00 4.13 [T] 2.03 1.59 2.00 . 4.82 [-] 4.13 4.06 4.13 4.82 . ; USERTYPE Region#1 STEPMATRIX = 15 [ 0 = GCA] [ 1 = GCAC] [ 2 = GCAT] [ 3 = GCC] [ 4 = GCCC] [ 5 = GCCCG] [ 6 = GCCG] [ 7 = GCTG] [ 8 = GGA] [ 9 = GGG] [ B = GGGC] [ D = GGGCA] [ E = GGGCAT] [ F = GGGCG] [ H = GGGCT] 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 B D E F H [0] . 1.0 1.0 1.0 2.0 2.0 2.0 2.0 1.0 2.0 3.0 1.0 3.0 2.0 2.0 [1] 1.0 . 1.0 1.0 1.0 2.0 2.0 2.0 2.0 3.0 2.0 3.0 2.0 3.0 3.0 [2] 1.0 1.0 . 2.0 2.0 3.0 2.0 2.0 2.0 3.0 3.0 4.0 1.0 4.0 3.0 [3] 1.0 1.0 2.0 . 1.0 1.0 1.0 2.0 2.0 2.0 2.0 2.0 3.0 2.0 2.0 [4] 2.0 1.0 2.0 1.0 . 1.0 1.0 2.0 3.0 3.0 2.0 3.0 3.0 3.0 3.0 [5] 2.0 2.0 3.0 1.0 1.0 . 1.0 2.0 3.0 2.0 3.0 3.0 4.0 2.0 3.0 [6] 2.0 2.0 2.0 1.0 1.0 1.0 . 1.0 3.0 2.0 3.0 3.0 3.0 2.0 3.0 [7] 2.0 2.0 2.0 2.0 2.0 2.0 1.0 . 3.0 2.0 3.0 4.0 3.0 3.0 4.0 [8] 1.0 2.0 2.0 2.0 3.0 3.0 3.0 3.0 . 1.0 2.0 1.0 2.0 2.0 2.0 [9] 2.0 3.0 3.0 2.0 3.0 2.0 2.0 2.0 1.0 . 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 [B] 3.0 2.0 3.0 2.0 2.0 3.0 3.0 3.0 2.0 1.0 . 1.0 1.0 1.0 1.0 [D] 1.0 3.0 4.0 2.0 3.0 3.0 3.0 4.0 1.0 1.0 1.0 . 1.0 1.0 1.0 [E] 3.0 2.0 1.0 3.0 3.0 4.0 3.0 3.0 2.0 1.0 1.0 1.0 . 2.0 1.0 [F] 2.0 3.0 4.0 2.0 3.0 2.0 2.0 3.0 2.0 1.0 1.0 1.0 2.0 . 1.0 [H] 2.0 3.0 3.0 2.0 3.0 3.0 3.0 4.0 2.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 . ; USERTYPE Region#2 STEPMATRIX = 15 [ 0 = AGTCA] [ 1 = ATGA] [ 2 = CAGA] [ 3 = CGGA] [ 4 = CGGGA] [ 5 = CGTCA] [ 6 = GGA] [ 7 = GGG] [ 8 = GGGA] [ 9 = GTCA] [ B = GTGA] [ D = TCA] [ E = TGA] [ F = TGCTA] [ H = TGTCA] 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 B D E F H [0] . 2.0 4.0 3.0 3.0 1.0 2.0 3.0 3.0 1.0 2.0 1.0 2.0 3.0 1.0 [1] 2.0 . 2.0 2.0 3.0 3.0 2.0 3.0 2.0 2.0 1.0 2.0 1.0 4.0 3.0 [2] 4.0 2.0 . 1.0 2.0 3.0 2.0 3.0 2.0 3.0 2.0 3.0 2.0 4.0 4.0 [3] 3.0 2.0 1.0 . 1.0 2.0 1.0 2.0 1.0 3.0 2.0 3.0 2.0 3.0 3.0 [4] 3.0 3.0 2.0 1.0 . 2.0 1.0 2.0 1.0 3.0 2.0 3.0 2.0 3.0 3.0 [5] 1.0 3.0 3.0 2.0 2.0 . 2.0 3.0 3.0 1.0 2.0 1.0 2.0 3.0 1.0 [6] 2.0 2.0 2.0 1.0 1.0 2.0 . 1.0 1.0 2.0 1.0 2.0 1.0 2.0 2.0 [7] 3.0 3.0 3.0 2.0 2.0 3.0 1.0 . 1.0 3.0 2.0 3.0 2.0 3.0 3.0 [8] 3.0 2.0 2.0 1.0 1.0 3.0 1.0 1.0 . 2.0 1.0 3.0 2.0 3.0 3.0 [9] 1.0 2.0 3.0 3.0 3.0 1.0 2.0 3.0 2.0 . 1.0 1.0 2.0 3.0 1.0 [B] 2.0 1.0 2.0 2.0 2.0 2.0 1.0 2.0 1.0 1.0 . 2.0 1.0 3.0 2.0 [D] 1.0 2.0 3.0 3.0 3.0 1.0 2.0 3.0 3.0 1.0 2.0 . 1.0 2.0 1.0 [E] 2.0 1.0 2.0 2.0 2.0 2.0 1.0 2.0 2.0 2.0 1.0 1.0 . 1.0 1.0 [F] 3.0 4.0 4.0 3.0 3.0 3.0 2.0 3.0 3.0 3.0 3.0 2.0 1.0 . 2.0 [H] 1.0 3.0 4.0 3.0 3.0 1.0 2.0 3.0 3.0 1.0 2.0 1.0 1.0 2.0 . ; USERTYPE Region#3 STEPMATRIX = 5 [ 0 = A] [ 1 = AT] [ 2 = G] [ 3 = GA] [ 4 = T] 0 1 2 3 4 [0] . 1.0 1.0 1.0 1.0 [1] 1.0 . 2.0 2.0 1.0 [2] 1.0 2.0 . 1.0 1.0 [3] 1.0 2.0 1.0 . 2.0 [4] 1.0 1.0 1.0 2.0 . ; USERTYPE Region#4 STEPMATRIX = 7 [ 0 = AC] [ 1 = AG] [ 2 = AGAG] [ 3 = GAG] [ 4 = GG] [ 5 = GGA] [ 6 = GGG] 0 1 2 3 4 5 6 [0] . 1.0 2.0 2.0 2.0 3.0 3.0 [1] 1.0 . 1.0 1.0 1.0 2.0 2.0 [2] 2.0 1.0 . 1.0 2.0 2.0 2.0 [3] 2.0 1.0 1.0 . 1.0 2.0 1.0 [4] 2.0 1.0 2.0 1.0 . 1.0 1.0 [5] 3.0 2.0 2.0 2.0 1.0 . 1.0 [6] 3.0 2.0 2.0 1.0 1.0 1.0 . ; OPTIONS DEFTYPE=unord PolyTcount=MINSTEPS ; EXSET * FULL16S = 1-39 71-76 81 86-90 92 119 182 195 196 329 556 575 685 686 728 741 754 767 779 852 968-979 984-992 1001 1121 1425 1428-1431 1452-1520 CONSTANT; TypeSet * 16Snuc = FULL16S:1-1520, Region#1:1521, Region#2:1522, Region#3:1523, Region#4:1524; ] END; [ BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions = N: 1-1520; CODESET * UNTITLED = Universal: all ; END; ] [ DELETE 1-36; ] BEGIN TREES; TREE 16SBkbn = ((((Beijerinckia_derxii,Beijerinckia_mobilis_DSM_2326,(Methylocapsa_acidiphila_B2,Methylocella_palustris),Beijerinckia_indica),Rhodoblastus_acidophilus),(((Afipia_felis,Pseudomonas_carboxydohydrogena),Oligotropha_carboxidovorans),((Nitrobacter_alkalicus,Nitrobacter_winogradskyi),Nitrobacter_hamburgensis_X14),Bradyrhizobium_elkanii,Bradyrhizobium_lupini,(Bradyrhizobium_japonicum,Blastobacter_denitrificans),Rhodopseudomonas_palustris,Afipia_broomeae),(((Methylobacterium_podarium_strain_FM3,Methylobacterium_populi_BJ001,Methylobacterium_thiocyanatum,Methylobacterium_lusitanum,Methylobacterium_zatmanii,Methylobacterium_chloromethanicum_CM4,Methylobacterium_aminovorans,Methylobacterium_suomiense,Methylobacterium_extorquens,((Methylobacterium_aquaticum,Methylobacterium_variabile),Methylobacterium_nodulans_ORS_2060),Methylobacterium_rhodinum,Methylobacterium_rhodesianum),Methylobacterium_adhaesivum_DSM_17169,(Methylobacterium_persicinum_002_165,Methylobacterium_komagatae_002_079),Methylobacterium_fujisawaense,Methylobacterium_radiotolerans_JCM_2831,Methylobacterium_mesophilicum,Methylobacterium_hispanicum,Methylobacterium_organophilum),Chelatococcus_asaccharovorans,Bosea_thiooxidans),(Methylocystis_echinoides,Methylosinus_trichosporium,(Methylosinus_acidophilus,Methylosinus_sporium),Methylocystis_parvus),((Starkeya_novella_DSM_506,Ancylobacter_aquaticus,Angulomicrobium_tetraedale),(Xanthobacter_autotrophicus,Azorhizobium_caulinodans_ORS_571,Xanthobacter_agilis,Xanthobacter_tagetidis)),(Rhodomicrobium_vannielii,(Pedomicrobium_australicum,Hyphomicrobium_facile_subsp_tolerans,(Hyphomicrobium_zavarzinii,Hyphomicrobium_hollandicum))),Prosthecomicrobium_pneumaticum,(Blastochloris_viridis,Blastochloris_sulfoviridis),(Rhodoplanes_elegans,Rhodoplanes_roseus)),Mycoplana_dimorpha,(Brucella_melitensis_16M,Ochrobactrum_anthropi),Bartonella_bacilliformis,Rhizobium_leguminosarum,Sinorhizobium_meliloti_1021,Mesorhizobium_amorphae,Phyllobacterium_myrsinacearum); END; [ #NEXUS Begin PAUP; set warntsave=no warnreset=no warntree=no warnroot=no; set autoclose=yes; set Tcompress=yes increase=auto autoinc=100; log file = [16SMPtopo1000paup.log]16SMPBP1000paup.log replace=yes; set criterion = parsimony; hsearch addseq=random nreps=1000 hold=1 swap=tbr Multrees=yes; savetrees file=16SMPtopo.tre brlens=yes; END; bootstrap treefile=16SMPBP.tre replace=yes nreps=1000 search=heuristic /addseq=random nreps=5 swap=tbr; end; ] BEGIN SETS; [ CHARSET excluded = 1-39 71-76 81 86-90 92 119 182 195 196 329 556 575 685 686 728 741 754 767 779 852 968-979 984-992 1001 1121 1417 1418 1425 1428-1431 1452-1520; ] CHARSET excluded = 1-498 556 575 685 686 728 741 754 767 779 852 968-979 984-992 1001 1121 1155-1520; END; BEGIN raxml; exclude excluded; mpi pe=high ncpus=50; constraint tree = 16SBkbn; raxml nreps=1000 model=GTRMIX intermediate=no; [ raxml model=GTRMIX bootstrap_seed=-1 nreps=1000; ] END; [ BEGIN mrbayes; set autoclose=yes nowarnings=yes; exclude 1-498 556 575 685 686 728 741 754 767 779 852 968-979 984-992 1001 1121 1155-1520; 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